Table 1 |
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|
Characteristics of the genes and their location (as derived from Genatlas [5]). |
||||||||
| Gene |
HGNC id |
Chromosome Location |
DNA (kb) |
Number of Transcripts |
mRNA |
Number of Exons |
Number of Amino Acids |
Structural part of Proteasome |
|
|
||||||||
|
|
||||||||
| PSMA1 |
9530 |
11p15,1 |
15,53 |
2 |
1453 |
11 |
269 |
ringA |
|
|
||||||||
| 1210 |
10 |
263 |
ringA |
|||||
|
|
||||||||
| PSMA2 |
9531 |
7p13 |
14,75 |
1 |
885 |
8 |
233 |
ringA |
|
|
||||||||
| PSMA3 |
9532 |
14q23 |
27,04 |
2? |
927 |
11 |
254 |
ringA |
|
|
||||||||
| 906 |
11 |
248 |
ringA |
|||||
|
|
||||||||
| PSMA4 |
9533 |
15q24,1 |
8,7 |
1 |
1172 |
9 |
261 |
ringA |
|
|
||||||||
| PSMA5 |
9534 |
1p13 |
24,57 |
1 |
974 |
9 |
241 |
ringA |
|
|
||||||||
| PSMA6 |
9535 |
14q13,2 |
25,13 |
1 |
1018 |
7 |
246 |
ringA |
|
|
||||||||
| PSMA7 |
9536 |
20q133 |
6,59 |
2? |
984 |
7 |
248 |
ringA |
|
|
||||||||
| 1069 |
7 |
ringA |
||||||
|
|
||||||||
| PSMB1 |
9537 |
6q27 |
18,12 |
1 |
882 |
6 |
241 |
ringB |
|
|
||||||||
| PSMB2 |
9539 |
1p34 |
40,43 |
1 |
845 |
6 |
201 |
ringB |
|
|
||||||||
| PSMB3 |
9540 |
17q12 |
11,42 |
1 |
753 |
6 |
205 |
ringB |
|
|
||||||||
| PSMB4 |
9541 |
1q21 |
2,4 |
1 |
925 |
7 |
264 |
ringB |
|
|
||||||||
| PSMB5 |
9542 |
14q11,2 |
8,79 |
1 |
1049 |
3 |
208 |
ringB |
|
|
||||||||
| PSMB6 |
9543 |
17p13 |
2,31 |
1 |
824 |
6 |
239 |
ringB |
|
|
||||||||
| PSMB7 |
9544 |
9q33 |
61,97 |
1 |
983 |
8 |
277 |
ringB |
|
|
||||||||
| PSMC1 |
9547 |
19p13,3 |
16,07 |
1 |
1586 |
11 |
440 |
base |
|
|
||||||||
| PSMC2 |
9548 |
7q22,1 |
20,49 |
1 |
1526 |
12 |
433 |
base |
|
|
||||||||
| PSMC3 |
9549 |
11p,13 |
7,67 |
1 |
1545 |
12 |
439 |
base |
|
|
||||||||
| PSMC4 |
9551 |
19q13,11 |
19,25 |
1 |
1433 |
11 |
418 |
base |
|
|
||||||||
| PSMC5 |
9552 |
17q24 |
4,53 |
1 |
1319 |
12 |
406 |
base |
|
|
||||||||
| PSMC6 |
9553 |
14q22,1 |
20,79 |
1 |
1579 |
14 |
389 |
base |
|
|
||||||||
| PSMD1 |
9554 |
2q37,1 |
115,82 |
1 |
3227 |
25 |
953 |
lid |
|
|
||||||||
| PSMD2 |
9559 |
3q27,3 |
9,79 |
1 |
2922 |
21 |
908 |
lid |
|
|
||||||||
| PSMD3 |
9560 |
17q21,1 |
17,2 |
1 |
2147 |
12 |
534 |
lid |
|
|
||||||||
| PSMD4 |
9561 |
1q21,2 |
12,74 |
2 |
1508 |
9 |
268 |
base |
|
|
||||||||
| 1313 |
10 |
377 |
base |
|||||
|
|
||||||||
| PSMD5 |
9563 |
9q33,3 |
26,8 |
1 |
3384 |
10 |
504 |
base |
|
|
||||||||
| PSMD6 |
9564 |
3p14,1 |
12,9 |
1 |
8 |
389 |
lid |
|
|
|
||||||||
| PSMD7 |
9565 |
16q23 |
9,5 |
1 |
1655 |
7 |
324 |
lid |
|
|
||||||||
| PSMD8 |
9566 |
19q13,13 |
8,66 |
1 |
1301 |
7 |
257 |
lid |
|
|
||||||||
| PSMD9 |
9567 |
12q24,31 |
29,1 |
2 |
2332 |
6 |
223 |
lid? |
|
|
||||||||
| 209 |
lid |
|||||||
|
|
||||||||
| PSMD10 |
9555 |
Xq22,3 |
7,4 |
2 |
1467 |
5 |
151 |
lid |
|
|
||||||||
| 1546 |
5 |
226 |
lid |
|||||
|
|
||||||||
| PSMD11 |
9556 |
17q12 |
38 |
1 |
1580 |
14 |
422 |
lid |
|
|
||||||||
| PSMD12 |
9557 |
17q24,3 |
28,7 |
2 |
3592 |
12 |
456 |
lid |
|
|
||||||||
| 3532 |
11 |
436 |
lid |
|||||
|
|
||||||||
| PSMD13 |
9558 |
11p15,5 |
15,96 |
2 |
1585 |
13 |
377 |
lid |
|
|
||||||||
| 1670 |
12 |
351 |
lid |
|||||
|
|
||||||||
| PSMD14 |
16889 |
2q24,3 |
103,7 |
1 |
1132 |
12 |
310 |
lid |
|
|
||||||||
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Simons Biology Direct 2009 4:37 doi:10.1186/1745-6150-4-37 |
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